1.靛基质试验 某些细菌能分解蛋白胨中的色氨酸，生成吲哚。吲哚的存在可用显色反应表现出来。吲哚与对二甲基氨基苯醛结合，形成玫瑰吲哚，为红色化合物。

试验方法：将待测纯培养物小量接种于色氨酸肉汤培养基中，于(36±1)℃培养24h时后，取约2mL培养液，加入Kovacs氏试剂2～3滴，轻摇试管，呈红色为阳性，或先加少量乙醚或二甲苯，摇动试管以提取和浓缩旋基质，待其浮于培养液表面后，再沿试管壁缓慢加入Kovacs氏试剂数滴，在接触面呈红色，即为阳性。

2.氨基酸脱羧酶试验 具有氨基酸脱羧酶的细菌，能使氨基酸生成胺，使培养基pH升高，使培养基指示剂显色。培养基变紫色为阳性反应，而培养基不变色为阴性反应，本试验一定要设空白对照。培养时需用液态石蜡封盖，阻止空气的氧化作用。本试验主要用于肠杆菌科细菌的鉴定，如沙门菌属中除伤寒沙门氏菌和鸡沙门菌外，其余沙门氏菌的赖氨酸和鸟氨酸脱羧酶均为阳性。志贺菌属除宋内氏志贺氏菌和鲍氏志贺菌B型的鸟氨酸为阳性外，其他志贺氏菌均为阴性。

3.硫化氢试验 某些细菌能分解含硫氨基酸生成硫化氢，与亚铁离子或铅离子结合形成黑色沉淀物。硫化氢试验主要用于鉴别肠杆菌科细菌。沙门菌属、枸橼酸杆菌属、变形杆菌属、爱德华菌属等硫化氢试验结果为阳性，其他菌属大多为阴性。但沙门菌属中亦有部分硫化氢阴性菌株，如甲型副伤寒沙门氏菌、仙台沙门氏菌、猪霍乱沙门氏菌等。

4.苯丙氨酸试验 细菌能将苯丙氨酸脱氨变成苯丙酮酸，酮酸能使三氯化铁指示剂变绿色。变形杆菌及普罗菲登斯菌有苯丙氨酸脱氨酶的活力，变绿色者为阳性。